WEKO3
アイテム
糖鎖構造情報学の基盤強化のための糖鎖リポジトリと単糖置換?列の開発
http://hdl.handle.net/10911/00040738
http://hdl.handle.net/10911/00040738cbeee5d8-9efc-4c3f-909d-b7dc2468d75f
| 名前 / ファイル | ライセンス | アクション |
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kogakukenkyuka_FUJITA-Akihiro(sinsa).pdf (2.5 MB)
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.png)
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kogakukenkyuka_FUJITA-Akihiro(yosi).pdf (775.8 kB)
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kogakukenkyuka_FUJITA-Akihiro(zen).pdf (3.4 MB)
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| Item type | 学位論文 / Thesis or Dissertation(1) | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 公開日 | 2022-03-30 | |||||||||
| タイトル | ||||||||||
| タイトル | 糖鎖構造情報学の基盤強化のための糖鎖リポジトリと単糖置換?列の開発 | |||||||||
| 言語 | ja | |||||||||
| タイトル | ||||||||||
| タイトル | Development of a glycan repository and monosaccharide substitution matrix to strengthen the foundation of glycan informatics | |||||||||
| 言語 | en | |||||||||
| 言語 | ||||||||||
| 言語 | jpn | |||||||||
| キーワード | ||||||||||
| 言語 | en | |||||||||
| 主題Scheme | Other | |||||||||
| 主題 | Glycan | |||||||||
| キーワード | ||||||||||
| 言語 | en | |||||||||
| 主題Scheme | Other | |||||||||
| 主題 | Glycan repository | |||||||||
| キーワード | ||||||||||
| 言語 | en | |||||||||
| 主題Scheme | Other | |||||||||
| 主題 | Glycoinformatics | |||||||||
| キーワード | ||||||||||
| 言語 | en | |||||||||
| 主題Scheme | Other | |||||||||
| 主題 | Monosaccharide substitution matrix | |||||||||
| 資源タイプ | ||||||||||
| 資源タイプ識別子 | http://purl.org/coar/resource_type/c_db06 | |||||||||
| 資源タイプ | doctoral thesis | |||||||||
| アクセス権 | ||||||||||
| アクセス権 | open access | |||||||||
| アクセス権URI | http://purl.org/coar/access_right/c_abf2 | |||||||||
| 著者 |
藤田, 晶大
× 藤田, 晶大
× Akihiro, FUJITA
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| 抄録 | ||||||||||
| 内容記述タイプ | Abstract | |||||||||
| 内容記述 | In glycoinformatics, GlyTouCan, the international glycan structure repository, has been instrumental to properly manage the increasing numbers of glycan structures being researched in glycobiology. We have performed a major update on the GlyTouCan batch system to ensure consistency in registering its structures. In GlyTouCan, in order to search for glycan structures, currently only exact match searches have been implemented. However, the similarity of glycans could be better evaluated by creating a more versatile monosaccharide substitution matrix. Therefore, we have created a monosaccharide substitution matrix that takes into consideration not only their 3D structures but also their physicochemical properties. In addition to searching for glycan structures, this is the first attempt to quantify the similarity of monosaccharides. We have also evaluated this substitution matrix on the human data in GlyTouCan, thus demonstrating its validity and applicability. |
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| 学位名 | ||||||||||
| 学位名 | 博士（工学） | |||||||||
| 学位授与機関 | ||||||||||
| 学位授与機関名 | 創価大学 | |||||||||
| 学位授与年月日 | ||||||||||
| 学位授与年月日 | 2022-03-18 | |||||||||
| 学位授与番号 | ||||||||||
| 学位授与番号 | 甲第187号 | |||||||||
| 著者版フラグ | ||||||||||
| 出版タイプ | VoR | |||||||||
| 出版タイプResource | http://purl.org/coar/version/c_970fb48d4fbd8a85 | |||||||||
